כניסה למערכת 
החברה התחילה את דרכה במתן שירותי תחבורה ציבורית בתחילת שנת 2001 כאשר זכתה במכרז להפעלת אשכול חדרה נתניה. כיום החברה מפעילה ארבעה אשכולות:
החברה מפעילה את האשכול החל מינואר 2002. במסגרת האשכול, מפעילה החברה 105 קווי תחבורה ציבורית.
החברה מפעילה את האשכול החל מפברואר 2009. במסגרת האשכול, מפעילה החברה 14 קווי תחבורה ציבורית.
אשכול יוקנעם נקלט לחברת נתיב אקספרס לאחר מיזוג חברת נאזרין אספר ונתיב אקספרס בינואר 2013. במסגרת האשכול, מפעילה החברה 50 קווי תחבורה ציבורית.
במסגרת הפעילות הענפה באשכולות מקפידה "נתיב אקספרס" על מתן שירות מקצועי ,אמין ובטוח לכלל נוסעיה ובדגש מיוחד על צרכי נוסעים בעלי מוגבלויות כל אשר יהיו, לשם כך מפעילה החברה מערכת כריזה מכוונת לוויינית שמודיעה בזמן הנסיעה על התחנות במסלול הקו, בנוסף למערכת שילוט אלקטרונית פנימית שמציגה את התחנות הנ"ל.
החברה מפעילה שירות next bus העוקב אחרי זמן הגעת האוטובוס לתחנות בקו הנסיעה בזמן אמת. כמו כן מפעילה החברה בחלק מהאוטובוסים אינטרנט אלחוטי המאפשר גלישה ללא תשלום לציבור הנוסעים.
הפעלת האוטובוסים בקווי התחבורה הציבורית על ידי החברה נעשים תוך שליטה הדוקה ובקרה מתמדת דבר המקנה לה יתרון עצום. לשם כך, מופעל מרכז בקרה סביב השעון בכל ימות השנה ונשען על תוכנות שליטה וניהול ציי רכב מהמתקדמות והמפותחות שיש, המותאמות לצרכי החברה על ידי מחלקת ניהול הידע שלה. המרכז מקנה אפשרות מעקב אחרי כל אוטובוס הכוללים מיקום, נתוני מהירות וכיווני נסיעה, ויכול לתת התראה על כל חריגה בנושאים הללו. בנוסף, משמש מרכז זה כמרכז שירות ומידע לציבור הלקוחות הרחב, הנותן מענה לכל פנייה בנושאי מסלולי נסיעה, מיקום תחנות, ולוחות זמנים.
"נתיב אקספרס" מקפידה על מתן מענה לכל צרכי הציבור שהיא משרתת בתחבורה ציבורית וכל זה על פי הסטנדרטים של הקבוצה אליה שייכת קבוצת עפיפי, ייחודיות, אמינות, זמינות, צניעות ואדיבות לאין קץ.
